Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rph3alQ768S4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rph3alQ768S4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rph3alQ768S4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rph3alQ768S4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms