Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Casc1Q6TDU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Casc1Q6TDU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Casc1Q6TDU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Casc1Q6TDU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Casc1Q6TDU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Casc1Q6TDU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms