Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrnp200Q6P4T2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snrnp200Q6P4T2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrnp200Q6P4T2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp200Q6P4T2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp200Q6P4T2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms