Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Colgalt2Q6NVG7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Colgalt2Q6NVG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Colgalt2Q6NVG7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Colgalt2Q6NVG7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms