Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2810408A11RikQ6NSU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2810408A11RikQ6NSU2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms