Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11bQ6DFW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp11bQ6DFW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp11bQ6DFW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp11bQ6DFW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms