Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rftn1Q6A0D4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Rftn1Q6A0D4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rftn1Q6A0D4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rftn1Q6A0D4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms