Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ifit1Q64282 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ifit1Q64282 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifit1Q64282 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifit1Q64282 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ifit1Q64282 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms