Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim24Q64127 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim24Q64127 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim24Q64127 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim24Q64127 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim24Q64127 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.7 ms