Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr2e1Q64104 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr2e1Q64104 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms