Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc1Q64028 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Phc1Q64028 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Phc1Q64028 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phc1Q64028 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc1Q64028 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms