Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col4a5Q63ZW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a5Q63ZW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col4a5Q63ZW6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a5Q63ZW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col4a5Q63ZW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms