Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifna11Q61716 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna11Q61716 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna11Q61716 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna11Q61716 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms