Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AlcamQ61490 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlcamQ61490 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AlcamQ61490 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AlcamQ61490 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AlcamQ61490 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AlcamQ61490 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms