Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc6Q61143 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc6Q61143 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc6Q61143 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc6Q61143 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpc6Q61143 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc6Q61143 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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