Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Neurod1Q60867 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Neurod1Q60867 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Neurod1Q60867 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Neurod1Q60867 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Neurod1Q60867 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.78■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Neurod1Q60867 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Neurod1Q60867 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms