Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdkn2dQ60773 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkn2dQ60773 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkn2dQ60773 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkn2dQ60773 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn2dQ60773 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms