Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha1Q60750 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha1Q60750 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha1Q60750 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha1Q60750 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha1Q60750 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha1Q60750 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha1Q60750 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Epha1Q60750 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha1Q60750 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha1Q60750 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha1Q60750 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Epha1Q60750 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha1Q60750 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha1Q60750 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha1Q60750 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha1Q60750 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha1Q60750 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha1Q60750 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha1Q60750 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha1Q60750 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epha1Q60750 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha1Q60750 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha1Q60750 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha1Q60750 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha1Q60750 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha1Q60750 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha1Q60750 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms