Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Specc1Q5SXY1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Specc1Q5SXY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Specc1Q5SXY1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Specc1Q5SXY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Specc1Q5SXY1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Specc1Q5SXY1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms