Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trdv2-2Q5R1A4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trdv2-2Q5R1A4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms