Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CoblQ5NBX1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CoblQ5NBX1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CoblQ5NBX1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CoblQ5NBX1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CoblQ5NBX1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CoblQ5NBX1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms