Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cep44Q5HZK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cep44Q5HZK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep44Q5HZK1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cep44Q5HZK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms