Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkaa1Q5EG47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkaa1Q5EG47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkaa1Q5EG47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkaa1Q5EG47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms