Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufaf2Q59J78 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufaf2Q59J78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ndufaf2Q59J78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufaf2Q59J78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf2Q59J78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms