Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otol1Q4ZJM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otol1Q4ZJM7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otol1Q4ZJM7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otol1Q4ZJM7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms