Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx25Q3ZT31 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx25Q3ZT31 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx25Q3ZT31 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx25Q3ZT31 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx25Q3ZT31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms