Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D5

Pnpla1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla1Q3V1D5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnpla1Q3V1D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnpla1Q3V1D5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnpla1Q3V1D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pnpla1Q3V1D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms