Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BC051142Q3V0M8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BC051142Q3V0M8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BC051142Q3V0M8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BC051142Q3V0M8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BC051142Q3V0M8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms