Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4930567H17RikQ3V0K5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930567H17RikQ3V0K5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms