Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mccc2Q3ULD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mccc2Q3ULD5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mccc2Q3ULD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mccc2Q3ULD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms