Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn7l3bQ3UD01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l3bQ3UD01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn7l3bQ3UD01 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms