Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmem109Q3UBX0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmem109Q3UBX0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem109Q3UBX0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem109Q3UBX0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem109Q3UBX0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms