Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pid1Q3UBG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pid1Q3UBG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pid1Q3UBG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pid1Q3UBG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pid1Q3UBG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pid1Q3UBG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pid1Q3UBG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pid1Q3UBG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pid1Q3UBG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms