Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trip13Q3UA06 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trip13Q3UA06 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip13Q3UA06 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip13Q3UA06 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip13Q3UA06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms