Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWH3

Pnrc1, MCG12570, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnrc1Q3TWH3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnrc1Q3TWH3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnrc1Q3TWH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnrc1Q3TWH3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnrc1Q3TWH3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pnrc1Q3TWH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnrc1Q3TWH3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1148.8 ms