Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf3c3Q3TMP1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf3c3Q3TMP1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms