Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdlim7Q3TJD7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdlim7Q3TJD7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pdlim7Q3TJD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdlim7Q3TJD7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdlim7Q3TJD7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms