Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul4aQ3TCH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul4aQ3TCH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul4aQ3TCH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul4aQ3TCH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cul4aQ3TCH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms