Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prok1Q14A28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Prok1Q14A28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prok1Q14A28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prok1Q14A28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms