Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Spatc1Q148B6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Spatc1Q148B6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Spatc1Q148B6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spatc1Q148B6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Spatc1Q148B6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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Spatc1Q148B6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Spatc1Q148B6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spatc1Q148B6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Spatc1Q148B6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Spatc1Q148B6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spatc1Q148B6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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