Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 RAD51YER095W 1203 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 RSM7YJR113C 744 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 MET13YGL125W 1803 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 PRB1YEL060C 1908 nt7.54□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 IGD1YFR017C 588 nt7.53□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 SRF1YDL133W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
NFI1Q12216 EMP65YER140W 1671 nt7.52□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 BUB2YMR055C 921 nt7.52□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 MOB1YIL106W 945 nt7.51□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 YFR020WYFR020W 699 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 YIR035CYIR035C 765 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 PAU15YIR041W 375 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 YLR030WYLR030W 792 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 RFS1YBR052C 633 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 PGC1YPL206C 966 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 ENO1YGR254W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 QCR6YFR033C 444 nt7.49□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.49□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 RSP5YER125W 2430 nt7.49□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 SEC24YIL109C 2781 nt7.48□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 INO1YJL153C 1602 nt7.48□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 TOD6YBL054W 1578 nt7.47□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 STP3YLR375W 1032 nt7.47□□□□□ -1.21
NFI1Q12216 YKR023WYKR023W 1593 nt7.46□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 FRE5YOR384W 2085 nt7.45□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 HDA1YNL021W 2121 nt7.45□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 RQC1YDR333C 2172 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 MRN1YPL184C 1839 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 BUD31YCR063W 474 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 FLX1YIL134W 936 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 YNL140CYNL140C 570 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 TIF3YPR163C 1311 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 CLN1YMR199W 1641 nt7.44□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.43□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 YLR460CYLR460C 1131 nt7.42□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 YBR284WYBR284W 2394 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 HAL5YJL165C 2568 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 LRO1YNR008W 1986 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 GLY1YEL046C 1164 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 ERP2YAL007C 648 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 TPK1YJL164C 1194 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 HMS2YJR147W 1077 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 DPH5YLR172C 903 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 RNA170RNA170 169 nt7.41□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.4□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 YLR280CYLR280C 351 nt7.4□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 IPL1YPL209C 1104 nt7.4□□□□□ -1.22
NFI1Q12216 DIP5YPL265W 1827 nt7.4□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 SGV1YPR161C 1974 nt7.4□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 EHT1YBR177C 1356 nt7.39□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 INM1YHR046C 888 nt7.39□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YBR232CYBR232C 360 nt7.39□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 CHS7YHR142W 951 nt7.38□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 CYC3YAL039C 810 nt7.38□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 MET22YOL064C 1074 nt7.38□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 RMD8YFR048W 1989 nt7.37□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 GRH1YDR517W 1119 nt7.37□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 TDA4YJR116W 840 nt7.37□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 OLA1YBR025C 1185 nt7.37□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 NOG2YNR053C 1461 nt7.36□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 SRP102YKL154W 735 nt7.36□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YOR300WYOR300W 309 nt7.36□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 TOS1YBR162C 1368 nt7.35□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 ERO1YML130C 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YIL177CYIL177C 5277 nt7.35□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 TKL2YBR117C 2046 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 BIM1YER016W 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 MRP7YNL005C 1116 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.34□□□□□ -1.23
NFI1Q12216 SEC23YPR181C 2307 nt7.33□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 ARO3YDR035W 1113 nt7.33□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.33□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RCF1YML030W 480 nt7.33□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 ALG7YBR243C 1347 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 MAL31YBR298C 1845 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RHO1YPR165W 630 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 OCH1YGL038C 1443 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 KTR4YBR199W 1395 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 WSC3YOL105C 1671 nt7.32□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 HXT2YMR011W 1626 nt7.31□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RRN10YBL025W 438 nt7.31□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 RSC9YML127W 1746 nt7.3□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 KIN1YDR122W 3195 nt7.3□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 YCR025CYCR025C 411 nt7.3□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 SHC1YER096W 1539 nt7.3□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 AIM3YBR108W 2844 nt7.3□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 EFM1YHL039W 1758 nt7.29□□□□□ -1.24
NFI1Q12216 HXT8YJL214W 1710 nt7.29□□□□□ -1.24
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