Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppp4r2Q0VGB7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ppp4r2Q0VGB7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppp4r2Q0VGB7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ppp4r2Q0VGB7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ppp4r2Q0VGB7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms