Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rundc1Q0VDN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rundc1Q0VDN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rundc1Q0VDN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rundc1Q0VDN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rundc1Q0VDN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms