Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gata4Q08369 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gata4Q08369 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gata4Q08369 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gata4Q08369 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms