Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HmgcrQ01237 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HmgcrQ01237 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HmgcrQ01237 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HmgcrQ01237 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HmgcrQ01237 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HmgcrQ01237 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms