Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SeleQ00690 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SeleQ00690 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeleQ00690 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SeleQ00690 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SeleQ00690 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SeleQ00690 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SeleQ00690 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SeleQ00690 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SeleQ00690 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SeleQ00690 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SeleQ00690 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SeleQ00690 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SeleQ00690 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SeleQ00690 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SeleQ00690 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SeleQ00690 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SeleQ00690 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms