Protein–RNA interactions for Protein: P98199

Atp8b2, Phospholipid-transporting ATPase ID, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b2P98199 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp8b2P98199 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp8b2P98199 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp8b2P98199 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp8b2P98199 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Atp8b2P98199 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b2P98199 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp8b2P98199 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms