Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SirpaP97797 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SirpaP97797 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SirpaP97797 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SirpaP97797 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SirpaP97797 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SirpaP97797 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SirpaP97797 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SirpaP97797 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SirpaP97797 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SirpaP97797 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SirpaP97797 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SirpaP97797 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SirpaP97797 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SirpaP97797 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SirpaP97797 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SirpaP97797 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SirpaP97797 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SirpaP97797 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SirpaP97797 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SirpaP97797 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms