Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hspd1P63038 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hspd1P63038 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hspd1P63038 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hspd1P63038 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hspd1P63038 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hspd1P63038 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hspd1P63038 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hspd1P63038 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Hspd1P63038 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hspd1P63038 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hspd1P63038 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hspd1P63038 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hspd1P63038 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hspd1P63038 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hspd1P63038 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hspd1P63038 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hspd1P63038 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hspd1P63038 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hspd1P63038 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hspd1P63038 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hspd1P63038 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms