Protein–RNA interactions for Protein: P61215

Ca10, Carbonic anhydrase-related protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca10P61215 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca10P61215 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ca10P61215 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ca10P61215 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca10P61215 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ca10P61215 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca10P61215 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ca10P61215 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca10P61215 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ca10P61215 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca10P61215 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca10P61215 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ca10P61215 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms